Cryptodifflugia angulata Playfair, 1917
Cryptodifflugia angusta (Schönborn, 1965) Page, 1966 (Difflugiella angusta Schönborn, 1965)
Cryptodifflugia angustatostoma Beyens et Chardez, 1982
Cryptodifflugia apiculata (Cash, 1904) Page, 1966 (Difflugiella apiculata Cash, 1904)
Cryptodifflugia bassini Bobrov, 2001
Cryptodifflugia compressa Penard, 1902
Cryptodifflugia crenulata Playfair, 1917
Cryptodifflugia horrida (Schönborn, 1965) Page, 1966 (Difflugiella horrida Schönborn, 1965)
Cryptodifflugia minuta Playfair, 1917
Cryptodifflugia oviformis Penard, 1890
Cryptodifflugia psammophila Golemansky, 1970 (Difflugiella psammophila Golemansky, 1970)
Cryptodifflugia pusilla Playfair, 1917
Cryptodifflugia sacculus Penard, 1902
Cryptodifflugia splendida (Schönborn, 1965) Page, 1966 (Difflugiella splendida Schönborn, 1965)
Cryptodifflugia voigti Schmidt, 1926
Cryptodifflugia vulgaris (Francé, 1913) Volz, 1928 (Difflugiella vulgaris Francé, 1913)